bioconductor

January 1, 0001
MitsuhaMiyamizu
mirror-help

Bioconductor 为高通量基因组数据的分析和可视化提供开源工具。Bioconductor多数软件包采用R统计编程语言开发。Bioconductor 每年释出两个版本，并有活跃的用户社区。

使用方法：

Bioconductor 镜像源配置文件之一是 ~/.Rprofile 。

注：R 的 ~ 在类 Unix 系统下为： $HOME （即 ~ ），在 Windows 下为： %USERPROFILE%\Documents ，具体路径可以在 R 中执行 path.expand("~") 查看。

在该文件末尾添加如下语句或在R/RStudio终端下键入:

options(BioC_mirror="https://mirror.sjtu.edu.cn/bioconductor")

即可使用该 Bioconductor 镜像源安装 Bioconductor 软件包。命令如下:

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("$package_name")

请访问官方网站获取更多信息。